A RMA reúne mais de 300 entidades filiadas, distribuídas nos 17 estados que se encontram no domínio do bioma Mata Atlântica.
Com o objetivo de levantar informações sobre elas, foi criado o banco de dados da Rede. Um de seus principais desafios é o fortalecimento da sua articulação com as entidades, principalmente aquelas situadas fora dos grandes centros.
As informações disponíveis no banco de dados permitem a configuração do perfil das filiadas da RMA e facilitam a comunicação entre as entidades. Além disso, os projetos ganham visibilidade, o que possibilita o contato com instituições de pesquisa e de financiamento em meio ambiente que costumam procurar a Secretaria Executiva em busca de informações.
As entidades filiadas à RMA têm o direito de participar e deliberar nas assembléias gerais. Além disso, podem votar e concorrer à composição do Conselho de Coordenação Nacional da RMA, do Conselho Fiscal, da Coordenação Geral e da Coordenação Institucional. Os representantes das filiadas podem exercer funções intermediárias e temporárias de cunho executivo, bem como cargos e representação, por outorga específica emitida pelo Conselho da RMA ao qual o cargo ou função estiver vinculado.
Podem, ainda, participar e usufruir das atividades desenvolvidas pela RMA, zelando pelo seu bom desempenho administrativo, programático e financeiro, promovendo sua boa imagem, a de seu corpo funcional e das organizações externas às quais estiver vinculada. As entidades filiadas à Rede são livres para apresentar propostas de ação. Por isso, a RMA assegura a possibilidade de participar, com direito a voz, em todas as instâncias da Rede.
Todas essas prerrogativas estão previstas no Estatuto e no Regimento da RMA, que estabelecem também os deveres das entidades filiadas. Entre eles, destaca-se a responsabilidade de observar e fazer cumprir o Estatuto e demais regulamentos da RMA, bem como as deliberações definidas em assembléia geral.
Pagar pontualmente as obrigações pecuniárias a que estiverem obrigadas também é dever das entidades, já que a inexistência de pendências viabiliza o trabalho da RMA.